O EdpopSUS 2 tem uma duração aproximada de 4 meses, totalizando 160 horas na modalidade presencial.
O curso está dividido em 136 horas presenciais e 24 horas de trabalho de campo.
São aproximadamente 17 encontros semanais de 8h cada intercalados com trabalhos de campo no território. 
 
Estrutura Curricular
| Eixos Temáticos | Presencial | Trabalho de campo | Total | 
|---|---|---|---|
| 
			 Eixo I: A construção da gestão participativa como fio condutor do processo educativo. | 
16h | 4h | 20h | 
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			 Eixo II: A educação popular no processo de trabalho em saúde | 
16h | 4h | 20h | 
| 
			 Eixo III: O direito à saúde e a promoção da equidade | 
24h | 4h | 28h | 
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			 Eixo IV: Território, lugar de história e memória | 
16h | 4h | 20h | 
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			 Eixo V: Participação social e participação popular no processo de democratização do Estado | 
24h | 4h | 28h | 
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			 Eixo VI: O território, o processo saúde-doença e as práticas de cuidado | 
32h | 4h | 36h | 
| 
			 Encerramento | 
8h | 8h | |
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			 Carga Horária Total do Curso | 
136h | 24h | 160h |